On Mon, Nov 17, 2003 at 8:10pm Damien Broderick <thespike@earthlink.net> wrote:<br><br>> Yeah, but consider: the genome got done faster than anyone expected,<br>> or at least *as* fast if you're scrupulous in your accounting. It's<br>> a pretty good paradigm. (True, the Powers That Be, public and private,<br>> flung a shitload of $$$ at it.)<br><br>Hmmmm.... an interesting example since I was one person who flung<br>a shitload of $$$ at it (relatively speaking).<br><br>The fundamental problem in doing the HGP was the need for high<br>throughput sequencing.  The powers that ran the project knew this<br>and I would guess that between the early-to-mid '90s probably threw<br>about $100M at solving the problem.  Perhaps $10M of that was really<br>effective -- there were about 5 academic groups at the time really<br>making good progress.  Applied Biosystems and Molecular Dynamics<br>on the industrial side might have been equal or double that effort.<br>But they were building on the academic work significantly.  I attempted<br>to run 2 groups in Russia to work on it at the time.  One got a working<br>but not industrial level product.  Cost was probably $200-400K.<br>In contrast the industrial level genome sequencing center at MIT<br>which used a lot of custom designed machinery probably cost tens<br>of millions of dollars.  However the high throughput genome centers<br>we (in the U.S.) have now (and those in Europe and Japan) are still cranking out genomic sequences at a high rate.<br><br>So the investment was worthwhile -- for perhaps for a combined<br>government/industry investment of $150M one got a cost reduction<br>in the HGP of perhaps $1B.  (I am guessing at these figures and they should not be cited without confirmation.)  But Damien is correct<br>that the HGP got done ahead of time and under budget.  A significant<br>reason for that was an investment in the basic technology required<br>to accomplish that.<br><br>One can consider past investments in basic technologies required<br>to move us (humanity) forward.  The Manhattan Project is the first that comes to my mind.  Of course one can adopt a variety of perspectives<br>as to whether these investments helped or hurt us.  In the case of the<br>HGP I would think they are helping us.<br><br>Robert<br><br><br>