<div dir="ltr"><div dir="ltr"><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Dec 1, 2020 at 4:11 PM spike jones via extropy-chat <<a href="mailto:extropy-chat@lists.extropy.org">extropy-chat@lists.extropy.org</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div lang="EN-US" style="overflow-wrap: break-word;"><div class="gmail-m_-7081122580816814991WordSection1"><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><div style="border-right:none;border-bottom:none;border-left:none;border-top:1pt solid rgb(225,225,225);padding:3pt 0in 0in"><p class="MsoNormal"><b>…</b>> <b>On Behalf Of </b>William Flynn Wallace via extropy-chat<br><b>Subject:</b> Re: [ExI] ‘The game has changed.’ AI triumphs at solving protein structures<u></u><u></u></p></div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:18pt;font-family:"Comic Sans MS"">>…<span style="color:black">Do y'all think that this is the best thing AI has ever done?  bill </span>w<u></u><u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:18pt;font-family:"Comic Sans MS""><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:18pt;font-family:"Comic Sans MS"">Entirely possible that it is the most significant advance AI has made with respect to how it will impact humanity’s future.<u></u><u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:18pt;font-family:"Comic Sans MS""><u></u> </span></p></div></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>### Some caveats are in order - the errors in the AI-simulated structures were on the order of 10 nm. This is not yet a practical solution of the protein folding problem, since to be able to use a structure to correctly predict ligand binding, enzymatic function and other functional aspects you need an accuracy of a fraction of a nanometer. Still, it's a huge leap forward and quite reminiscent of the first AphaGo and other game AIs - going from nothing to middling (protein folding is here now) to very good to smashing the best human to vastly superhuman in just 3 - 4 years. It everything goes well we might indeed have an AI capable of whole-cell predictive metabolic and maybe even structural modeling using only genome in the next few years. </div><div><br></div><div>If this capability became available it would be the biggest inflection point in the whole history of biology and medicine, greater than antibiotics, anesthesia and any other single advance. It would allow stunningly fast development of highly advanced pharmaceuticals, biotherapeutics and implantable devices, orders of magnitude faster than now.</div><div><br></div><div>Old-timers here may recall that twenty-something years ago on this list I proposed the solution of the protein folding problem as a way for an UFAI to quickly defeat humanity. The UFAI could use the predictive capability afforded by protein structure modeling to create both a self-replicating computational substrate to live in and the self-replicating weapons (or bioweapons) to kill us. Looks like no UFAI is needed to solve protein folding.....  hopefully AlphaFAI, the grandson of AlphaFold, will be here to protect us when the UFAI is (almost inevitably) created.</div><div><br></div><div>Rafal</div></div></div>